Am un certificat SSL obișnuit și un IP dedicat. Există vreun dezavantaj dacă folosesc un certificat SSL gratuit Let’s Encrypt și același IP?

Nu. Datorită tehnologiei SNI (suportată de orice browser modern), mai multe certificate SSL pot funcționa pe același IP, fără a fi nevoie de IP-uri suplimentare. Poți folosi un certificat Let’s Encrypt gratuit pe același IP fără niciun dezavantaj tehnic.